Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17333C6EQI3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms