Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms