Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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PtprbB2RU80 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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