Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms