Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms