Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms