Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssxb8B1AY40 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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