Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms