Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms