Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp8b5A3FIN4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Atp8b5A3FIN4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp8b5A3FIN4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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