Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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