Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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