Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms