Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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