Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms