Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms