Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frmpd4A2AFR3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms