Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1lA2A5N3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms