Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms