Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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