Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Crlf3Q9Z2L7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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