Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms