Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn7Q9Z261 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms