Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms