Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap3b1Q9Z1T1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms