Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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VarsQ9Z1Q9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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VarsQ9Z1Q9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VarsQ9Z1Q9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VarsQ9Z1Q9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VarsQ9Z1Q9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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VarsQ9Z1Q9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms