Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn9Q9Z0S7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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