Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms