Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Col4a3Q9QZS0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms