Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms