Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkrn1Q9QXP6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkrn1Q9QXP6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms