Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limd1Q9QXD8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms