Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms