Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dclk1Q9JLM8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms