Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms