Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FancaQ9JL70 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FancaQ9JL70 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms