Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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