Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Upk3aQ9JKX8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms