Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms