Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms