Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
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Rb1cc1Q9ESK9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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Rb1cc1Q9ESK9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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Rb1cc1Q9ESK9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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Rb1cc1Q9ESK9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
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