Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp29Q9ES63 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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