Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sil1Q9EPK6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sil1Q9EPK6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms