Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf6Q9DBU5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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