Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc97Q9DBT3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms