Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Subh2bvQ9D9Z7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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