Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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