Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifi35Q9D8C4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms