Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf2lQ9D478 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2lQ9D478 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms