Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy3Q9D394 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms